Doxycyklin se používá k léčbě infekcí způsobených mikroorganismy citlivými na doxycyklin,
zvláště:

Infekce dýchacích cest a krční, nosní a ušní infekce:
- náhlé vzplanutí vleklého zánětu průdušek,
- záněty vedlejších nosních dutin (sinusitida),
- záněty středního ucha (otitis media),
- záněty plic (pneumonie) vyvolané mykoplazmaty, chlamydiemi a riketsiemi.

Infekce močového ústrojí:
- infekční zánět močové trubice způsobený chlamydiemi a Ureaplasma urealyticum,
- náhlý zánět prostaty,
- nekomplikovaná kapavka (zvláště se současnou infekcí vyvolanou chlamydiemi),
- infekce ženského pohlavního ústrojí,

- syfilis (u pacientů se známou alergií na penicilin),
- močové infekce (v případě, že byla u původce/ů prokázána citlivost na doxycyklin).

Infekce zažívacího ústrojí:
- cholera,
- infekce vyvolané yersiniemi nebo campylobaktery,
- infekce vyvolané shigelami s prokázanou citlivostí na doxycyklin.

Infekce žlučových cest u ambulantních pacientů:
Některá onemocnění kůže, například těžké infikované formy akné a růžovky (rosacey).

Zřídka se vyskytující infekce: brucelóza, ornitóza, bartonelóza, listerióza, rickettsióza.

Jiná onemocnění:
- malabsorbční syndrom (onemocnění, kdy je narušeno vstřebávání a trávení v trávicím
ústrojí) jako jsou např. tropická sprue a Whippleho choroba.

Při použití přípravku je třeba dbát oficiálních doporučení pro správné používání
antibakteriálních léčivých látek.

Přípravek mohou užívat dospělí a děti od věku 12 let.