Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků se může zvýšit, pokud se Valganciclovir kombinuje se Stavudinem. Koncentrace valgancikloviru v séru se může zvýšit, pokud je kombinován s kyselinou mykofenolovou. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků se může zvýšit, pokud se Valganciclovir kombinuje s Lamivudinem. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků se může zvýšit, pokud se Valganciclovir kombinuje s abakavirem. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků může být zvýšeno při kombinaci Valgancicloviru s Entecavirem. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků se může zvýšit, pokud se Valganciclovir kombinuje se Zidovudinem. Koncentrace Tenofovir-disoproxilu v séru může být zvýšena, pokud je kombinován s Valganciclovirem. Sérová koncentrace Valgancicloviru může být zvýšena, pokud je kombinován s Probenecidem. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků se může zvýšit, pokud se Valganciclovir kombinuje s didanosinem. Riziko nebo závažnost generalizovaných záchvatů se může zvýšit, pokud se Valganciclovir kombinuje s Imipenemem. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků se může zvýšit, pokud se Valganciklovir kombinuje se zalcitabinem. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků se může zvýšit, pokud se Valganciclovir kombinuje s emtricitabinem.